Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cmc2Q8K199 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cmc2Q8K199 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cmc2Q8K199 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cmc2Q8K199 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cmc2Q8K199 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cmc2Q8K199 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cmc2Q8K199 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cmc2Q8K199 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cmc2Q8K199 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cmc2Q8K199 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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