Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI15

Sphk1, Sphingosine kinase 1, mousemouse

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk1Q8CI15 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sphk1Q8CI15 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sphk1Q8CI15 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sphk1Q8CI15 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sphk1Q8CI15 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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