Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms