Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms