Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms