Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Usp20Q8C6M1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Usp20Q8C6M1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Usp20Q8C6M1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Usp20Q8C6M1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Usp20Q8C6M1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp20Q8C6M1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms