Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka5Q8C050 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms