Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZ97

Prdm8, PR domain zinc finger protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm8Q8BZ97 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm8Q8BZ97 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms