Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY35

Fgd2, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd2Q8BY35 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms