Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms