Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms