Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms