Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdca8Q8BHX3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms