Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGP6

Slc25a40, Solute carrier family 25 member 40, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a40Q8BGP6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc25a40Q8BGP6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc25a40Q8BGP6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms