Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Lrrc1Q80VQ1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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