Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK1

Rfx4, Transcription factor RFX4, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx4Q7TNK1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms