Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg4Q7TMD7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms