Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms