Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Cep290Q6A078 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Cep290Q6A078 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Cep290Q6A078 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Cep290Q6A078 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Cep290Q6A078 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Cep290Q6A078 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Cep290Q6A078 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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