Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC080695Q66JY9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC080695Q66JY9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms