Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3bQ62177 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms