Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grik1Q60934 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik1Q60934 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik1Q60934 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik1Q60934 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik1Q60934 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik1Q60934 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik1Q60934 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik1Q60934 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik1Q60934 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik1Q60934 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik1Q60934 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik1Q60934 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik1Q60934 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms