Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf4Q60793 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms