Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med13Q5SWW4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms