Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RilpQ5ND29 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RilpQ5ND29 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms