Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms