Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp3Q3ULW8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp3Q3ULW8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms