Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Nkx6-3Q3UHX8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Nkx6-3Q3UHX8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Nkx6-3Q3UHX8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Nkx6-3Q3UHX8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Nkx6-3Q3UHX8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Nkx6-3Q3UHX8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Nkx6-3Q3UHX8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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