Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nom1Q3UFM5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms