Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3W5

Prmt9, Protein arginine N-methyltransferase 9, mousemouse

Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt9Q3U3W5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt9Q3U3W5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prmt9Q3U3W5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prmt9Q3U3W5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prmt9Q3U3W5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prmt9Q3U3W5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prmt9Q3U3W5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms