Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms