Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp39Q3TIX9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms