Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col24a1Q30D77 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col24a1Q30D77 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms