Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms