Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms