Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms