Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms