Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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SgcdP82347 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcdP82347 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SgcdP82347 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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