Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms