Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl1P61211 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arl1P61211 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arl1P61211 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arl1P61211 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms