Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms