Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P58686 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P58686 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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