Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux1P53564 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux1P53564 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cux1P53564 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux1P53564 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms