Protein–RNA interactions for Protein: P49183

Dnase1, Deoxyribonuclease-1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnase1P49183 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnase1P49183 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Dnase1P49183 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnase1P49183 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnase1P49183 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms