Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms