Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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RxrgP28705 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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