Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxraP28700 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxraP28700 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxraP28700 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxraP28700 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxraP28700 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxraP28700 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxraP28700 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxraP28700 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxraP28700 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxraP28700 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxraP28700 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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RxraP28700 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxraP28700 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxraP28700 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxraP28700 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxraP28700 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxraP28700 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxraP28700 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxraP28700 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxraP28700 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxraP28700 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxraP28700 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxraP28700 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxraP28700 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxraP28700 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxraP28700 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxraP28700 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxraP28700 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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