Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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Hoxd10P28359 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Hoxd10P28359 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Hoxd10P28359 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Hoxd10P28359 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Hoxd10P28359 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Hoxd10P28359 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Hoxd10P28359 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Hoxd10P28359 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
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Hoxd10P28359 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Hoxd10P28359 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Hoxd10P28359 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Hoxd10P28359 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms