Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms