Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms